清金匮县设于境内。1951年设立无锡市第一区。1955年更名为崇安区，以境内原古刹崇安寺命名。1958年撤销工运区并入崇安区。1960年改称崇安人民公社。1962年复名崇安区。1966年更名为崇武区。1978年恢复崇安区（无锡市革命委员会1978年8月25日报告备案）。
1991年，设立江海街道。1992年，撤销工运桥街道、亭子桥街道合并设立新的工运路街道，撤销复兴路街道、崇安街道合并设立新的崇安寺街道。1996年，全区面积7.3平方千米，人口16万人，辖8个街道：崇安寺街道、人民路街道、学前街街道、工运路街道、 周山浜街道、上马墩街道、 广瑞路街道、江海街道。区政府驻崇安寺街道。
2000年第五次人口普查，崇安区（辖8个街道）总人口176580人，其中： 崇安寺街道10938人、人民路街道26396人、学前街街道19062人、工运路街道14662人、周山浜街道17445人、广瑞路街道25690人、上马墩街道33909人、江海街道28478人。
2002年，将滨湖区广益镇划归崇安区管辖。调整后，崇安区辖8个街道、1个镇：崇安寺街道、人民路街道、学前街街道、工运路街道、周山浜街道、上马墩街道、广瑞路街道、江海街道、广益镇。
2004年崇安区行政区划调整，将8个街道、1个镇并为6个街道：撤销广益镇，设立广益街道；人民路街道、学前街街道并入崇安寺街道；工运路街道、周山浜街道合并为通江街道；广瑞路、上马墩、江海3街道不变。调整后，崇安区辖6个街道：崇安寺街道、通江街道、上马墩街道、广瑞路街道、江海街道、广益街道。全区常住人口27.5万人，户籍人口18.49万人。
2009年末，崇安区总面积18平方千米、总人口18.70万人（数据来源于《江苏省统计年鉴》）。
2011年，崇安区面积16.48平方千米，人口185101人。辖广益、崇安寺、通江、广瑞路、上马墩、江海6个街道，共有39个社区。区政府驻解放南路688号。
