相传隋代此处有一风穴，故名凤里，后建凤里庵，建有石亭，旁立一对石狮，名为石狮亭，商旅往来，以石狮为标记，久之遂成惯称。唐武德元年（618年），石狮境内行政区域属建州南安县。开元六年（718年），析南安东南地置晋江县，石狮境域属泉州晋江县。宋初，石狮境域属平海军晋江县，后属泉州晋江县。元代，属泉州路（一度改称泉州府）晋江县。明代，石狮境域属泉州府晋江县。
清代，石狮境域属泉州府晋江县。乾隆三十一年（1766年），增设晋江县石狮分县。以晋江县贴堂县丞驻石狮街，代管安海。乾隆三十五年，石狮县丞移驻安海旧通判署，嗣后，改设安海分县，石狮一带事务仍归晋江县处理。民国元年，石狮境域属南路道晋江县。民国三年，属厦门道晋江县。民国十六年，属福建省晋江县。民国廿三年7月，属福建省第五行政督察区晋江县。民国廿四年10月，属福建省第四行政督察区晋江县。
1942年设石狮镇，属晋江县。1949年9月2日解放。1987年12月17日，析晋江县石狮、蚶江、永宁3个镇和祥芝乡，置石狮市，为省辖县级市，由泉州市代管，并作为福建省综合改革试验区。1988年9月30日石狮市正式成立。
1990年10月，撤销石狮镇建制，成立石狮街道。1991年10月，撤销祥芝乡建制，成立祥芝镇。1993年7月，石狮街道一分为四，成立宝盖镇、灵秀镇、凤里街道、湖滨街道。1999年9月，从祥芝镇分设鸿山镇、锦尚镇（锦尚镇面积13.72平方千米，人口2.24万人）。至此，石狮市辖2个街道、7个镇：凤里街道、湖滨街道、灵秀镇、宝盖镇、蚶江镇、永宁镇、祥芝填、鸿山镇、锦尚镇。
2000年第五次人口普查，石狮市常住总人口498786人，其中：湖滨街道81494人，凤里街道79052人，灵秀镇75261人，宝盖镇54757人，蚶江镇56953人，祥芝镇43714人，鸿山镇33157人，锦尚镇24666人，永宁镇49732人。
2003年末，石狮市辖凤里、湖滨2个街道和永宁、蚶江、祥芝、宝盖、灵秀、鸿山、锦尚7个镇，2个居委会、19个社区、101个行政村。全市总户数79857户，总人口303120人，其中非农业人口100934人。湖滨街道29984人，凤里街道32449人，灵秀镇52110人，宝盖镇67379人，蚶江镇49586人，祥芝镇30941人，鸿山镇29444人，锦尚镇22377人，永宁镇53474人。
2005年，石狮市辖湖滨、凤里2个街道，灵秀、宝盖、蚶江、永宁、祥芝、鸿山、锦尚7个镇，共有20个社区、1个居委会、101个行政村。
2010年第六次人口普查，石狮市常住总人口636700人，其中：湖滨街道85196人，凤里街道72634人，灵秀镇124116人，宝盖镇91807人，蚶江镇76426人，祥芝镇52080人，鸿山镇41561人，锦尚镇33396人，永宁镇59484人。
