春秋、战国时期为吴、越、楚之属地，汉为南城县地，隶属豫章郡。三国吴太平二年（257年）析南城县南部置丰县，属临川郡。因县境内常产一茎多穗之稻，故初名丰县，别号嘉禾。又以徐州有丰县，故名南丰县。宋属建昌军。南宋绍兴八年（1138）划出南丰南境三乡置广昌县。元至元十九年（1282）升为南丰州。明洪武三年（1370）复为县，隶建昌府。
1931～1934年，南丰县大部分地域为革命根据地，建立过县苏维埃政权，属江西省苏维埃政府管辖。中华人民共和国成立前夕，隶属江西省第七行政区。1949年8月17日，南丰解放。先后属抚州专区、抚州地区（1970年）、抚州市（2000年）。
1979年，设立洽村、朱坊公社（赣革发[1979]146号）。1985年3月15日，撤销太和乡，设置太和镇（赣府厅字[1985]160号）。
2000年，全县面积1909平方千米，人口25.2万。辖3个镇、14个乡：琴城镇、太和镇、白舍镇、东坪乡、洽湾乡、沙岗乡、市山乡、桥背乡、莱溪乡、太源乡、三溪乡、桑田乡、西溪乡、波罗乡、中和乡、洽村乡、傅坊乡。县政府驻琴城镇。
2000年第五次人口普查，全县总人口260738人，其中：琴城镇50163人、太和镇21196人、白舍镇15077人、桥背乡24790人、市山乡25681人、沙岗乡5516人、三溪乡9055人、洽湾乡15012人、东坪乡7121人、莱溪乡16071人、桑田乡13699人、太源乡9104人、付坊乡14581人、中和乡10757人、波罗乡7994人、洽村乡7938人、西溪乡6983人。
2001年3月2日，撤销洽湾乡、桑田乡，设立洽清镇、桑田镇（赣民字[2001]94号批复）。2001年11月8日，撤销桥背乡，划归琴城镇；撤销沙岗乡、市山乡，合并组建市山镇；撤销西溪乡、洽村乡，合并组建紫霄镇，镇政府驻洽村；撤销中和乡、波罗乡，划归白舍镇（赣民字[2001]509号批复）。
2002年底，南丰县面积1909平方千米，人口27.9万人，其中非农业人口4.7万人。辖7个镇、5个乡，7个居委会、176个行政村。县政府驻琴城镇。
2003年底，全县总人口27.2万人，辖7镇5乡。
