汉元鼎六年（前111）属始安县。唐至德二年（757）属临桂县辖地，1913年属桂林县地。1940年属桂林市凤北镇、西南附廓乡，1950年设第三区和北郊区，1955年改三皇、北站2街道，1958年改三皇、北站2公社，1966年更名东风、胜利公社，1979年东风、胜利公社合并置叠彩区。
1996年底行政区划调整前，叠彩区面积11.2平方千米，人口约9.4万人。辖叠彩、和平、凤凰、凤北、建军、群建、东镇、鹦鹉、观音阁、芦笛、九华、驿前、北外、虞山、新码、新风、清风、抗战、新建、城北、水塔、铁路、胜利23个居委会。区政府驻凤北路。是桂林地区行署所在地。
1996年12月2日，国务院批准对桂林市市辖区的行政区划作相应调整：扩大叠彩区的行政区域，将原郊区大河乡、穿山乡的清风村划归叠彩区管辖。区政府驻凤北路。
2000年第五次人口普查，叠彩区总人口134401人，其中：叠彩街道58911人，北门街道48116人，大河乡27374人。
2003年叠彩区行政区划（根据当年广西行政区划代码整理）
001叠彩街道辖宝积、叠彩、鹦鹉、虞山、回龙、观音、芦笛、九华8个社区居委会。
002北门街道辖清风、锦绣、城北、凤凰、铁路、金河6个社区居委会。
200大河乡辖四联、新民、群力、上阳、蒙正、大河、潘家、尧山、大村、白竹干、清风、五福、星华、乌石、南洲15个村委会。
2006年1月6日，叠彩区政府从凤北路8号搬迁至中山北路147号新综合办公大楼办公。
