水富县名系水河、水东、安富三公社各取一字之合称。远古为k人居地，秦时属西南夷k侯国。两汉属犍为郡k道县（今宜宾市），三国蜀汉及西晋属益州犍为郡k道县。南朝梁武帝大同十年（544）在焚道置戎州，水富属戎州。北朝周武帝保定三年·南朝陈文帝天嘉四年（563）改戎州为外江县，水富属外江县。隋开皇六年（586），在外江县的“野容川”（今盐津县滩头乡）置开边县，水富随之属开边县。唐永泰二年（766），开边县治迁马湖江、朱提江两江口（金沙江、横江汇流处），辖今水富县等地。唐南诏国时朱提江以西的开边县地（包括水富县全境）属拓东节度辖阿旁部。宋乾德五年（967）废开边县并入k道县，属梓州府路戎州。政和四年（1114）改k道县为宜宾县。
南宋属宜宾县，隶梓州府路叙州。元代属四川行省叙州路宜宾县。明代属四川布政司叙州府宜宾县。清代，今向家坝镇的大部属四川省叙州府宜宾县，其中安富属宜宾县开边乡，光绪后改名安边乡，水东、水河属宜宾县水过河乡，两碗乡属云南省昭通府大关厅盐井渡巡检司；今向家坝镇新安、新寿及太平乡属云南省昭通府永善县。光绪三十四年（1908）永善县析置靖江分县，宣统二年（1910）正式核准为“靖江县”，今向家坝镇新安、新寿及太平乡属云南省昭通府靖江县。民国二年（1913），大关厅改称大关县，两碗乡属大关县。民国三年（1914），靖江县更名为绥江县，今向家坝镇新安、新寿及太平乡属绥江县。民国六年（1917），大关县析设盐津县，两碗乡属盐津县。
新中国成立后，今水富县地域分属四川省宜宾县及云南省昭通专区绥江县、盐津县。1974年2月，“云南天然气化工厂”选址在宜宾县安边区安富公社金沙江畔的滚坎坝。为解决“云天化”建设用地问题，1974年5月2日，川滇两省举行《四川省宜宾地区宜宾县安富、水东、水河公社划归云南省管辖的行政区划调整协议书》签字仪式，将四川省宜宾县安边区的安富公社，横江区的水东公社、水河公社，共20个大队、166个生产队，5139户、23933人，总面积约80平方千米，耕地27066亩，全部划归云南省昭通地区管辖。三个公社划归云南后，川滇两省在这一地段的省界，以金沙江、横江的江心为界。5月14日，川滇两省革委联合向国务院作出报告。5月24日，云南省革委又向国务院作出申请。5月下旬，昭通地委、地革委决定：将三个公社合建为一个区，由地区直接管理；区的规模，为县的架子，参照绥江县的机构设置和人员配备。关于区的名称，讨论中提出三种意见，即安水区、安富区、安化区，最后决定暂称“安化区”（没有对外公布）。因“特区”要报经中央审批，名称定为“区”。6月下旬，根据省里意见，取水东、水河之“水”和安富之“富”，定名“云南省昭通地区水富区”。
1974年7月1日，国务院以国发【1974】70号文件批复川滇两省革委：“同意将四川省宜宾县安富、水东、水河三个公社划归云南省绥江县管辖，建厂期间，昭通地区可加强领导。”同日，昭通地委正式发出通知“安富、水东、水河3个公社划入云南省后，成立为一个区，定名为昭通地区水富区”，直属昭通地区，建立“中共云南省昭通地区水富区委员会”和“云南省昭通地区水富区革命委员会”，水富区正式建立。同日起，宜宾县管辖的安富、水东、水河公社正式移交昭通地区管辖。7月4日，区委、区革委从安边镇人民旅馆迁到安富公社社部木楼办公（后于1975年初迁到区委、区革委在“雷打石”处建设的区机关简易房办公，1981年秋再迁“马公公”处新建的区机关办公楼，即现县城人民东路县政府办公楼办公）。8月5日，云南省革命委员会通知：“在交接期间已经成立的水富区仍保持现状不变，过渡一个时期，积极做好工作，待条件成熟后，在划归绥江县管辖。至于今后是否设区的问题，将根据实际情况，再行确定”。
1974年8月8日，水富区委召开会议研究区城镇建设问题。从不占用良田、方便建材运输、顺江与云天化生活区连成一片、长远发展等出发，将区址选定在云天化厂区下面金沙江边，即以牛皮滩为中心，在金沙江边兴建水富区城镇。1975年3月，宜宾县与水富区就安富、水东、水河3个公社的交接工作全面结束。4月2日，水富区革委向省革委、地革委作出《关于四川划归云南的安富等三个公社行政区划调整协议执行情况报告》。
1976年，区委、区革委为解决水河公社农业生产用水问题，决定在与水河公社相连的位于绥江县会仪公社新寿大队第13、20、21生产队之间的水清坝修建水库。1977年8月4日，地委批复同意，为便于管理水库，将三个生产队划归水富区水河公社管辖。并强调：三个生产队划归水河公社后，可单独成立为一个生产大队。9月8日，绥江县正式将三个生产队移交给水富区。三个生产队地域总面积6平方千米，总户数68户，总人口316人。9月9日，根据地委批复，区委将三个生产队组建为水河公社新田大队，将原生产队按顺序改称新田1队、2队、3队。至此，水富区的地域总面积增加到86平方千米。
1980年12月6日，云南省人民政府向国务院提出设置水富县的请示。1981年8月14日国务院批复：设立水富县。以水富区的安富、水东、水河3个公社，绥江县的太平公社和会仪公社的新安、新寿两个大队，以及与水富区相邻的盐津县的两碗公社，划归水富县管辖；县人民政府驻云富公社，水富县由昭通地区行署领导。9月10日，省政府批准设立水富县云富镇，以安富公社的安富大队和云天化厂区、水富县属机关单位为云富镇的行政区域；云富镇下设云天化厂区、水富县属机关单位2个居委会和一个郊区农业大队（安富大队）；云富镇为水富县人民政府驻地。9月21日，绥江县的太平公社和会仪公社的新寿大队、新安大队与盐津县的两碗公社移交给水富县管辖。10月1日，水富县正式成立，下辖五个公社（安富、水东、水河、太平、两碗公社）、一个镇（云富镇）和两个直属大队（新寿、新安大队）。【以上摘自水富县政府网站，有所改动】
1981年底，全县总面积426平方千米，总人口69545人，其中云天化3371人。1994年，全县土地详查，总面积为439.8平方千米。1996年，水富县辖2个镇、2个乡：云富镇、楼坝镇、太平乡、两碗乡。县政府驻云富镇。2000年第五次人口普查，水富县常住总人口89973人，其中：云富镇38057人，楼坝镇20544人，太平乡14874人，两碗乡16498人。
2000年10月，水富县辖2个镇、2个乡，2个居委会、21个行政村。2001年8月，昭通撤地设市，水富县属昭通市。2002年，全县辖2个镇、2个乡，21个村委会；全县人口总户数2.69万户，其中：农业户数1.84万户，总人口9.70万人，其中：农业人口7.19万人；苗、彝、壮等14个少数民族占总人口的4％。
2004年9月30日，《关于撤销水富县云富镇楼坝镇合并设立向家坝镇的批复》（云政复[2004]98号）：同意撤销云富镇、楼坝镇，合并设立向家坝镇，镇政府驻原云富镇政府驻地。2008年末，全县户籍人口10.06万人；常住人口9.60万人，其中：农业人口7.00万人，非农业人口2.60万人。辖1个镇、2个乡：向家坝镇、太平乡、两碗乡。共有4个居委会、21个行政村。县政府驻向家坝镇。2010年第六次人口普查，水富县常住总人口102143人，其中，向家坝镇72283人，太平乡14621人，两碗乡15239人。
2012年9月19日，省政府批复同意撤销水富县太平乡、两碗乡，设立太平镇、两碗镇；两碗镇政府驻地从两碗村迁移至花坛村青坪栈（云政复[2012]77号）。2012年11月29日，正式由向家坝镇析置设立云富街道。至此，全县辖1个街道、3个镇：云富街道、向家坝镇、太平镇、两碗镇。县政府驻云富街道。
