1959年，云南省辖6专区、2省辖市、8自治州，2市、105县、15自治县、5版纳、1镇、6市辖区、1山区。
昆明市6区
盘龙区五华区西山区官渡区海口区安宁区
东川市
昭通专区驻昭通县11县
昭通县(城区公社)巧家县(城关镇)彝良县(角奎镇)大关县(城关镇)永善县(井底公社)
绥江县(中城镇)威信县(扎西镇)镇雄县(城关公社)盐津县(盐井镇)鲁甸县(文屏镇)
会泽县(城关镇)
曲靖专区驻曲靖县10县2自治县
曲靖县(西平镇)富源县(中安镇)宣威县(榕城公社)宜良县(匡远镇)陆良县(中枢镇)
罗平县(罗雄)师宗县(丹凤镇)泸西县(中枢镇)嵩明县(嵩阳镇)马龙县(通泉镇)
路南彝族自治县(城关镇)寻甸回族自治县(仁德乡)
玉溪专区驻玉溪县10县1自治县
玉溪县(城关公社)澄江县(城关公社)新平县(城关镇)易门县(城关公社)元江县(红河公社)
杞麓县(城关镇)华宁县(城关公社)晋宁县(昆明镇)呈贡县(龙城镇)江川县(大街镇)
峨山彝族自治县(城关公社)
丽江专区驻丽江纳西族自治县2县2自治县
永胜县(永胜镇)华坪县(中心镇)
丽江纳西族自治县(大研镇)宁蒗彝族自治县(大村街)
临沧专区驻临沧县5县2自治县
临沧县(城关镇)镇康县(德党镇)双江县(勐勐)云县(云城镇)凤庆县(顺城镇)
耿马傣族佧佤族自治县(城关镇)沧源佧佤族自治县(勐董乡)
思茅专区驻思茅县6县3自治县1山区
思茅县(复兴镇)普洱县(磨黑镇)景谷县(威远)镇沅县(按板镇)景东县(锦屏镇)
墨江县(联珠镇)孟连傣族拉祜族佤族自治县(孟连城子)澜沧拉祜族自治县(勐朗镇)
江城哈尼族彝族自治县(勐烈镇)西盟山区(西盟)
楚雄彝族自治州驻楚雄县16县
楚雄县(鹿城镇)大姚县(金碧镇)禄丰县(金山镇)武定县(近城镇)禄劝县(屏山镇)
元谋县(元马镇)牟定县(共和镇)永仁县(永定镇)罗次县(碧城镇)富民县(永定镇)
广通县(一平浪镇)双柏县(云龙镇)南华县(龙川镇)姚安县(栋川镇)盐丰县(石羊镇)
红河哈尼族自治州驻个旧市1市9县2自治县
个旧市
建水县(城关镇)曲溪县(曲江)石屏县(城关镇)龙武县(龙朋镇)元阳县(新街镇)
红河县(迤萨镇)金平县(城关镇)绿春县(大兴镇)弥勒县(弥阳镇)
河口瑶族自治县(城关公社)屏边苗族自治县(玉屏)
文山僮族自治州驻文山县8县
文山县(红旗公社)丘北县(城关镇)西畴县(新街)马关县(马白公社)广南县(莲峰公社)
富宁县(板仑公社)麻粟坡县(麻粟镇)砚山县(江那镇)
西双版纳傣族自治州驻版纳景洪5版纳
版纳景洪(允景洪)版纳勐海(象山公社)版纳易武(易武)版纳勐遮(勐遮)版纳勐腊(勐腊镇)
大理白族自治州驻下关市1市12县2自治县
下关市
永平县(老街)弥渡县(弥城镇)祥云县(八一公社)宾川县(石榴村)洱源县(玉湖镇)
云龙县(新云镇)邓川县(新州镇)剑川县(金华镇)鹤庆县(城关镇)大理县(中和镇)
漾濞县(上街)凤仪县(凤鸣镇)巍山彝族自治县(巍宝公社)永建回族自治县(大仓街)
德宏傣族景颇族自治州驻潞西县芒市10县1镇
潞西县(芒市镇)瑞丽县(勐卯镇)盈江县(平原镇)陇川县(城子镇)梁河县(遮岛镇)
莲山县(小平原)保山县(城关公社)龙陵县(城关镇)腾冲县(城保镇)昌宁县(上游公社)
畹町镇
怒江傈僳族自治州驻碧江县4县1自治县
碧江县(知子罗)福贡县(上帕)泸水县(鲁掌镇)兰坪县(拉鸡井)
贡山独龙族怒族自治县(上游公社)
迪庆藏族自治州驻中甸县3县
中甸县(中心镇)维西县(保和镇)德钦县(升平镇)
县级以上行政区划变更情况
★榕峰县改名为宣威县。（国务院1959年11月30日批准）
◎将相当于自治县的澜沧拉祜族自治区改名为澜沧拉祜族自治县。（云南省民政厅1959年12月10日报告）
◎将相当于自治县的孟连傣族拉祜族佤族自治区改名为孟连傣族拉祜族佤族自治县。（云南省民政厅1959年12月10日报告）
◎撤销奔子栏办事处(县级)，划归德钦县。（1959年5月11日）
◎撤销昆明市龙泉区，并入官渡区（1959年9月22日云南省人民委员会第三次会议决定）
