2006年末，福建省辖9个地级市，14个县级市、45个县、26个市辖区。
县级以上行政区划及驻地一览
福州市（鼓楼区）辖5个市辖区、6个县，代管2个县级市
鼓楼区台江区仓山区马尾区
晋安区
福清市（玉屏街道）长乐市（吴航街道）
闽候县（甘蔗街道）连江县（凤城镇）罗源县（凤山镇）闽清县（梅城镇）
永泰县（樟城镇）平潭县（潭城镇）
厦门市（思明区）辖6个市辖区
思明区海沧区湖里区集美区（集美街道）
同安区（大同街道）翔安区（新店镇）
莆田市（城厢区）辖4个市辖区、1个县
城厢区涵江区（涵东街道）荔城区秀屿区（笏石镇）
仙游县（鲤城街道）
三明市（梅列区）辖2个市辖区、9个县，代管1个县级市
梅列区三元区
永安市
明溪县（雪峰镇）清流县（龙津镇）宁化县（翠江镇）大田县（均溪镇）
尤溪县（城关镇）沙县（凤岗街道）将乐县（古镛镇）泰宁县（杉城镇）
建宁县（濉城镇）
泉州市（丰泽区）辖4个市辖区、5个县，代管3个县级市
鲤城区丰泽区洛江区泉港区（山腰街道）
石狮市（湖滨街道）晋江市（青阳街道）南安市（溪美街道）
惠安县（螺城镇）安溪县（凤城镇）永春县（桃城镇）德化县（浔中镇）
金门县
漳州市（芗城区）辖2个市辖区、8个县，代管1个县级市
芗城区龙文区
龙海市（石码街道）
云霄县（云陵镇）漳浦县（绥安镇）诏安县（南诏镇）长泰县（武安镇）
东山县（西埔镇）南靖县（山城镇）平和县（小溪镇）华安县（华丰镇）
南平市（延平区）辖1个市辖区、5个县，代管4个县级市
延平区
邵武市（昭阳街道）武夷山市（崇安街道）建瓯市（芝山街道）建阳市（潭城街道）
顺昌县（双溪街道）浦城县（南浦街道）光泽县（杭川镇）松溪县（松源镇）
政和县（熊山街道）
龙岩市（新罗区）辖1个市辖区、5个县，代管1个县级市
新罗区
漳平市（菁城街道）
长汀县（汀州镇）永定县（凤城镇）上杭县（临江镇）武平县（平川镇）
连城县（莲峰镇）
宁德市（蕉城区）辖1个市辖区、6个县，代管2个县级市
蕉城区（蕉北街道）
福安市福鼎市（桐山街道）
寿宁县（鳌阳镇）霞浦县（松城街道）柘荣县（双城镇）屏南县（古峰镇）
古田县（新城镇）周宁县（狮城镇）
县级以上行政区划变更情况
★2006年2月13日，国务院《关于同意福建省泉州市人民政府驻地迁移的批复》（国函[2006]9号）：同意泉州市人民政府驻地由泉州市鲤城区庄府巷迁至泉州市丰泽区景观东路。
乡镇一级调整情况
2006年5月26日，省政府（闽政文[2006]217号）批复同意政和县撤销熊山镇建制，设立熊山街道办事处。原熊山镇的行政区域为熊山街道办事处的行政区域，熊山街道办事处驻原熊山镇政府驻地胜利街330号。
2006年9月25日，省政府（闽政文[2006]441号）批复同意清流县撤销东华乡，现有东华乡并入龙津镇。合并后的龙津镇辖城东、城南、蔬菜、大路口、严坊、横溪、南岐、桥下、供坊、俞坊、暖水、基头、下戈、拔里14个村委会和渔沧、长兴、凤翔、翠园4居委会，镇人民政府驻现东华乡人民政府驻地长兴南街17号。
