1959年底，福建省辖6专区、2省辖市，3市、63县、6市辖区。
县级以上行政区划一览
福州市3区
鼓楼区台江区仓山区
厦门市3区1县
开元区思明区鼓浪屿区
同安县（城关镇）
南平专区专署驻南平市1市16县
南平市
南平县（南平市）顺昌县（城关）尤溪县（城关）沙县（城关）将乐县（城关）泰宁县（城关）
崇安县（城关）光泽县（杭川镇）邵武县（城关）三明县（城关）
福安专区专署驻福安县9县
宁德县（蕉城镇）福鼎县（城关）霞浦县（城关镇）福安县（城关）寿宁县（城关）周宁县（城关）
罗源县（城关）松溪县（城关镇）政和县（城关）
闽候专区专署驻闽候县7县
闽候县（螺洲镇）闽清县（梅城镇）永泰县（城关）长乐县（城关镇）福清县（城关）平潭县（城关）
连江县（城关镇）
晋江专区专署驻泉州市1市10县
泉州市
惠安县（城关）晋江县（青阳）南安县（溪美）安溪县（城关镇）永春县（城关）德化县（城关）
莆田县（城厢镇）仙游县（城关镇）大田县（城关）金门县
龙溪专区专署驻漳州市1市10县
漳州市
龙溪县（漳州市）海澄县（城关镇）云霄县（城关）漳浦县（城关）诏安县（城关）长泰县（城关）
龙岩专区专署驻龙岩县10县
龙岩县（城关）长汀县（城关）永定县（城关）上杭县（城关）武平县（城关）漳平县（城关）
连城县（城关）永安县（城关）清流县（城关镇）宁化县（城关）
县级以上行政区划变更情况
◎同意将三明新建市与三明县合并，成立三明人民公社党委会和三明人民公社筹委会，直属省委和省人委领导。（1959年2月6日中共中央通知福建省委、省人委）
◎将南平专区管辖的松溪、政和两县划归福安专区管辖。（1959年7月1日福建省人民委员会批准）
★设立闽侯专署，专署驻闽侯县，领导原属福州市的闽侯县，福安专区的长乐、连江2县，晋江专区的永泰、平潭、福清3县和南平专区的闽清等7个县。（1959年8月1日国务院批准，1959年10月21日省人民委员会委员会议决定）
1959年春，撤销东山县人民公社联合社及生产团建制，恢复城关人民公社。
1959年11月，南靖县公社名称改用驻地名称（山城公社）。
