1999年底，内蒙古自治区辖7盟、5省辖市，17县、15市、49旗、3自治旗、17市辖区。
县级以上行政区划一览
呼和浩特市4区、4县、1旗
玉泉区回民区新城区
郊区
托克托县（城关镇）清水河县（城关镇）和林格尔县（城关镇）
武川县（可可以力更镇）土默特左旗（察索齐镇）
包头市6区、1县、2旗
东河区青山区昆都伦区
九原区石拐区白云矿区
固阳县（金山镇）土默特右旗（萨拉齐镇）达尔罕茂明安联合旗（百灵庙镇）
乌海市3区
海勃湾区乌达区海南区
赤峰市3区、2县、7旗
红山区元宝山区松山区
林西县（林西镇）宁城县（天义镇）喀喇沁旗（锦山镇）
敖汉旗（新惠镇）翁牛特旗（乌丹镇）巴林右旗（大板镇）
巴林左旗（林东镇）阿鲁科尔沁旗（天山镇）克什克腾旗（经棚镇）
通辽市1区、1市、1县、5旗
科尔沁区
霍林浩特市
开鲁县（开鲁镇）科尔沁左翼中旗（保康镇）科尔沁左翼后旗（甘旗卡镇）
库伦旗（库伦镇）奈曼旗（大沁他拉镇）扎鲁特旗（鲁北镇）
乌兰察布盟驻集宁市2市、5县、4旗
集宁市丰镇市
兴和县（城关镇）卓资县（卓资山镇）商都县（城关镇）
凉城县（城关镇）化德县（城关镇）察哈尔右翼前旗（土贵乌拉镇）
察哈尔右翼中旗（科布尔镇）察哈尔右翼后旗（白音察干镇）四子王旗（乌兰花镇）
锡林郭勒盟驻锡林浩特市2市、1县、9旗
锡林浩特市二连浩特市
多伦县（城关镇）阿巴嘎旗（新浩特镇）西乌珠穆沁旗（巴彦乌拉浩特镇）
东乌珠穆沁旗（乌里雅斯太镇）苏尼特左旗（满都拉图镇）太仆寺旗（宝昌镇）
正蓝旗（敦达浩特镇）苏尼特右旗（赛汉塔拉镇）正镶白旗（察汗塔拉镇）
镶黄旗（新宝拉格镇）
呼伦贝尔盟驻海拉尔市6市、4旗、3自治旗
海拉尔市满洲里市扎兰屯市
牙克石市根河市额尔古纳市
陈阿尔虎旗（巴彦库仁镇）新巴尔虎左旗（阿木古郎镇）新巴尔虎右旗（阿拉坦额莫勃镇）
阿荣旗（那吉镇）鄂伦春自治旗（阿里河镇）鄂温克族自治旗（巴彦托海镇）
莫力达瓦达斡尔族自治旗（尼尔基镇）
伊克昭盟驻东胜市1市、7旗
东胜市
准格尔旗（薛家湾镇）乌审旗（达布察克镇）伊金霍洛旗（阿勒腾席连镇）
鄂托克旗（乌兰镇）鄂托克前旗（敖勒召其镇）杭锦旗（锡尼镇）
达拉特旗（树林召镇）
巴彦淖尔盟驻临河市1市、2县、4旗
临河市
五原县（城关镇）磴口县（巴彦高勒镇）杭锦后旗（陕坝镇）
乌拉特前旗（西山咀镇）乌拉特中旗（海流图镇）乌拉特后旗（赛乌素镇）
阿拉善盟驻阿拉善左旗3旗
阿拉善左旗（巴彦浩特镇）阿拉善右旗（额肯呼都格镇）额济纳旗（达兰库布镇）
兴安盟驻乌兰浩特市2市、1县、3旗
乌兰浩特市阿尔山市
突泉县（突泉镇）
扎赉特旗（音德尔镇）科尔沁右翼前旗（乌兰浩特市）科尔沁右翼中旗（白音胡硕镇）
县级以上行政区划变更情况
★1999年1月13日国务院【国函5号】批复
1．同意撤销哲里木盟和县级通辽市，设立地级通辽市，市人民政府驻新设立的科尔沁区。
2．通辽市设立科尔沁区，以原县级通辽市的行政区域为科尔沁区的行政区域。区人民政府驻科尔沁大街102号。
3．通辽市辖原哲里木盟的科尔沁左翼中旗、科尔沁左翼后旗、库仑旗、奈曼旗、扎鲁特旗、开鲁县和新设立的科尔沁区。原哲里木盟的霍林郭勒市（县级）由自治区直辖。
★同意包头市郊区更名为九原区，石拐矿区更名为石拐区。（1999年8月10日民政部【民发22号】批复）
